位于(👖)东京西部的巨大“学园都市”。在总人口(🏰)达230万人，其中约8成是学生的这座都(💀)市中(🔔)，实施着(👄)超能(⌛)力开发的(🙁)特殊课程，学(🌟)生们的能力(🤮)被给(👠)予(🕳)从“无能力Level 0”到“超(👱)能力Level 5”的六(⏺)阶段(🚉)评价。 　　高中生上条当麻，也是(🉐)住在学园都市的学生之一。他由于隐藏在右手中的(🍪)力(⭕)量——只(🌴)要是异(☕)能之力，就连神的加护都能消(🖇)除(🚊)的“幻想(👨)杀(🦃)手Imagine Breaker”，而(😂)被(🌨)评价为名落孙山(⬅)的“无(⚓)能(🏀)力”，过着充满不幸的人生。 　　而上条的学生生活，由于暑假开始时从天而(📥)降的纯白修女而(🏌)发(🤼)生了巨大的变化。自从与逃离“魔法”世界的她——“禁书目录茵蒂克(🙎)丝”相遇开始，上(🔴)条就被(🌜)卷入(🤔)了各种各样的事件(💮)中。统率学园(➖)都市的“科学”方、与茵蒂克丝(🕠)关联的“魔法”方，在惊险地解决双方(🤷)事(🌇)件(👺)的过程中，他的人(😬)际关系也逐步扩展。之后，魔法一方的十字教最大(🐁)宗派(💨)罗马正教，终于注意到上条的存在……。 　　如同呼(🗡)应魔法方(👡)一般，科学方(🕕)的学园都市(🍍)也有所动作。但也有(🃏)与逐渐开始(🥠)对(💥)立的世界(💕)动(👭)向抗争的(😡)人不(⏬)断出现。那些通(🤸)过与上条有所关联，而(🕶)使命(🏖)运大为改变的(💤)“英雄”们。 　　他(👦)们挺身而出与世界对峙。如同上(🌕)条(🏚)当麻做过的那样。 　　科学与(🌺)魔法第三次交织之时(🚴)，故事将大幅推(🧘)进！！