位于东京西部的巨大“学园都市”。在总人口达230万人，其中约(🤬)8成是学(❕)生的这座(💦)都(🤙)市(👚)中，实(😓)施着超能力开发的特殊课程，学(🌎)生们(🕵)的能力被给予从“无能力(🌇)Level 0”到“超能力Level 5”的六阶段评价(🤶)。 　　高(🗽)中生上条当麻，也是住在学(📎)园都市的学生之一。他(⏫)由于隐藏在右手(🐋)中的力量(🕌)——只要是异能之(🏔)力，就连神(➖)的加护都能消(⤴)除的“幻想杀手Imagine Breaker”，而被评价为名落孙山的(🛀)“无(🚬)能力”，过着充满不幸的人生。 　　而(🤳)上条的学生(🎋)生(㊗)活，由于(🚵)暑(🐩)假(💧)开(📳)始时从天而降的纯白修女而发(⏳)生了巨大的变化。自(♒)从与逃离“魔法”世界的她(🧞)——(🕚)“禁书目录(🏋)茵蒂克丝”相遇开始，上条就被卷入了各种各样的事(🧟)件中。统(🦒)率(🥁)学园都市的“科(🕹)学”方、与茵蒂克丝关联的“魔法(🧡)”方，在惊险地(🈺)解决双方事件的过程(🥄)中，他的人际关系也逐(🚿)步扩(🍄)展。之后，魔法一方的十字(😣)教最大宗派罗马正教，终于注意到上条的存(💼)在……。 　　如同呼(🤨)应魔法方一(🥕)般(🗾)，科学方的学园都市也(🎆)有(👙)所动作。但也有与逐渐开始对立的世界(🎟)动向抗争的人不断出现。那些(👪)通过与上(🍖)条有所关联，而使命运大(🥅)为改变的(🐄)“英(🌲)雄”们。 　　他们挺身(👭)而出与世界对峙(🚓)。如(😵)同上条当麻(〽)做过的那样。 　　科学与魔(♌)法(📓)第三次交(🥕)织之时，故事将大幅推进！！