位于东京西部的巨大“学园都市”。在总人口达230万人，其中约8成是学生(🧔)的这座都市中，实施着(⛩)超能(🕖)力开发的特(🔜)殊课程，学生们(🎃)的能力被给予从“无能(🎪)力(🎑)Level 0”到“超能(📼)力Level 5”的六阶(👚)段评价。 　　高中生上条当(🧤)麻，也是住在学园都市的学生之一。他由于(🤧)隐藏在(🗝)右手中(🍜)的力量——只要是(😷)异能之力(🗑)，就(🐹)连神(📰)的加护都能消(🏌)除的(🎏)“幻(📽)想(😔)杀手Imagine Breaker”，而被评价为名落(😅)孙山的“无(🐠)能力(🍩)”，过(🧞)着充(💀)满不幸的人生。 　　而上(🙇)条的(🔐)学生生活，由于暑假(🙀)开始时从天而降的纯(❣)白修女而发生了巨大的变化。自从与逃离“魔(🔬)法(🤤)”世界的她——“禁书目录(🕒)茵蒂(🍌)克丝”相遇(🤯)开始，上(🚜)条就被卷入了各种各(🍳)样的事件中。统率学园都市的“科学”方、与茵蒂克丝关联的“魔法(🐖)”方，在(🚠)惊险地解决(🗄)双方事件的过程中(👛)，他的人际关(🈺)系也(🎋)逐步扩展。之后，魔法一方的十字(⏬)教最(🐽)大(🈷)宗派罗马(🥣)正(🎿)教，终于注意到(🆗)上条的存在…(⛴)…。 　　如同呼(🚐)应魔法(💢)方一般(🔵)，科学(🏚)方的学园(🕎)都市也有所动作。但也有与逐渐开(🈶)始对立的(🐌)世(🆓)界动向抗(🤹)争的人不断出现。那些通过与上条有所关联，而使命运大为(⛹)改变的“英雄”们。 　　他们挺身(🎽)而出与世界对峙。如同上条当麻(🎈)做过(🧜)的那样(🐝)。 　　科学与魔法(🕚)第三次交织之时，故事将大幅推进(🎂)！！