工(🚻)藤新一是全国著名(🐪)的高(😼)中生侦探，在(🤧)一次追查(🧐)黑衣人(🔜)犯罪团伙时不幸被团伙(🀄)成员发(🙃)现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小(🆗)孩！新(👗)一找到了(🏘)经常帮助他(👔)的阿(🛫)笠博士，博士(🦐)为他度(💅)身打造不少间谍武器。为(🛐)了防止犯罪团伙对他进行(👑)报复，新一决定隐姓埋名，暗中(🏧)追查他们，希望能得到(🎼)解药。一日，新一 的女友毛(💩)利兰来到了阿笠博士的(🤚)家寻找男友的下落，被小兰撞(🗝)见的新一情急(🥎)之下编(🐋)造了自己名叫江(🍋)户川柯(👙)南，随(🐅)后柯(➡)南寄(⚫)居在了小兰家。小兰(🆔)的父亲毛利小五郎是(🕯)一名私家侦探(🐓)，新一可以(🥕)籍着和他一起四出办案一起追(💧)查黑夜人的下落(🐀)。柯(🍤)南在小学认识步美等小学生(🏃)，他们一起组织了一个少年(💆)侦探团，向罪犯宣战！